Hiện nay, ngành Giải phẫu bệnh - Tế bào học đóng vai trò then chốt trong việc chẩn đoán, tiên lượng và tầm soát các bệnh ung thư, đồng thời góp phần xây dựng các phác đồ điều trị cá thể hóa cho từng người bệnh.
Trong lĩnh vực ung thư học, Giải phẫu bệnh - Tế bào học được coi là "Tiêu chuẩn vàng" giúp cung cấp những thông tin quan trọng và chính xác nhất cho các bác sĩ lâm sàng, gồm: typ ung thư, đặc điểm mô bệnh học, mức độ ác tính của tế bào u, khả năng xâm lấn của khối u, tình trạng di căn hạch và di căn xa, cũng như giai đoạn bệnh, đặc biệt, giúp phân biệt khối u nguyên phát với khối u thứ phát, phát hiện các dấu ấn phân tử liên quan đến điều trị đích và điều trị miễn dịch kháng u, đồng thời tiên lượng bệnh.
Với những bệnh không u, Giải phẫu bệnh giúp tìm nguyên nhân và cơ chế gây bệnh cũng như mối liên quan giữa tổn thương giải phẫu bệnh với biểu hiện lâm sàng. Những căn cứ này là nền tảng không thể thiếu để xây dựng phác đồ điều trị hiệu quả cho mỗi bệnh nhân, đồng thời là cơ sở cho việc giảng dạy và nghiên cứu khoa học.
